بدأت عمادة شؤون الطلبة في جامعة مؤتة أعمالها  كدائرة من دوائر الجامعة نشأة الجناح المدني فيها وحتى العام 1990 حيث صدر قرار مجلس التعليم العالي رقم (409) تاريخ 13/1/1990 باعتمادها عمادة من عمادات الجامعة .

تهدف عمادة شؤون الطلبة التي أنشئت سنة 1990 ، إلى تنمية الوعي الثقافي والاجتماعي لدى الطلبة وتوطيد علاقة الجامعة بهم وبالمجتمع المحلي ، والإعداد للانتخابات الطلابية وتنمية روح المسؤولية والانتماء لدى الطلاب ، وإصدار المطبوعات ذات العلاقة بالطلبة ومتابعة أحوالهم، وتقديم المساعدات المادية وغير المادية وتأمين السكن، وإعداد البرامج للنشاطات الثقافية والفنية والرياضية للطلاب، ومتابعة كثير من القضايا عن طريق مكتب الإرشاد وتوفير الحلول الممكنة لها، وتقديم الخدمات الطبية للطلبة بالتعاون مع المركز الصحي في الجامعة وإلقاء المحاضرات وعقد الندوات في المجال الصحي ، وتقديم الجوائز الرمزية والعينية والمادية للطلبة المتفوقين أكاديمياً وتقديم القروض والمنح للطلبة المحتاجين .